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23-03

成功案例|黑龙江省新型斑点热立克次体B8菌株的全基因组测序及比较基因组分析

我国斑点热群立克次体感染主要包含黑龙江斑点热立克次体引起的远东斑点热和西伯利亚斑点热立克次体引起的北亚热。近年来，黑龙江斑点热立克次体引起的人类疾病受到越来越多的关注。本研究从我国中东部地区一名经蜱叮咬就医患者血液中分离出斑点热立克次体，通过PCR及构建系统进化树确定新分离的菌株属于黑龙江斑点热立克次体（B8），并结合全基因组测序及比较基因组学分析，确定了B8独特的潜在遗传位点，可用于与其他黑龙江立克次体及基因组相似性较高的斑点热立克次体的鉴别。···
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23-02

RNA-seq+ATAC-seq+ChIP-seq联合分析揭示了肾癌的表观遗传景观

本研究利用ATAC-seq、ChIP-seq和RNA-seq进行综合多组学分析建立了一个肿瘤抑制因子模型，在该模型中，SETD2介导的H3K36me3缺失激活增强子，通过调节染色质可及性来驱动致癌转录输出。此外，作者还发现了通过靶向特异性组蛋白伴侣复合物（包括ASF 1A/B和SPT 16）来治疗SETD2缺陷型癌症的基础策略。···
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23-02

空间转录组学联合单细胞转录组学鉴定肝细胞癌微环境中的肿瘤免疫屏障

肝细胞癌（HCC）是肝癌中最常见的组织学亚型，也是癌症相关死亡的第三大原因。虽然可切除的HCC患者可以通过手术切除或肝移植治疗，晚期不可切除的HCC患者可以使用索拉非尼治疗，但这些肿瘤在治疗后容易复发。该研究整合了单细胞和空间转录组数据，以确定与免疫治疗有效相关的肝癌TME中的TIB结构，并发现SPP1+巨噬细胞是一个潜在的HCC的临床治疗靶点，阻断这个靶点可以破坏HCC免疫抑制环境的屏障，促进CD8+T细胞向肿瘤的渗透。该研究提供了一种新的治疗策略，可以用来破坏细胞之间的相互作用，并可与免疫检查点抑制剂联合使用，以提高HCC的治疗效果。···
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23-02

宏基因组学和代谢组学联合分析揭示了早发性结直肠癌中不同肠道微生物组衍生的表型

各种器官早发癌症的增加已成为全球关注的问题，特别是50岁之前诊断的早发性结直肠癌（EO-CRC），其发病率在世界许多地区稳步上升。本研究报道了对LO-CRC（晚发性结直肠癌）和EO-CRC患者的肠道微生物组、代谢组和微生物KO基因的大规模综合分析。通过利用多组学数据，首次尝试揭示LO-CRC和EO-CRC患者的粪便微生物群失调和代谢组失调的共同状态，并确定独特的微生物-代谢物相互作用。基于多组学的生物标志物在区分EO-CRC患者与年龄匹配的对照组方面具有强大的优势。虽然还需要更多的机制研究和临床验证，但该研究强调需要进一步研究肠道微生物与年轻人CRC风险之间的潜在关联。···