成功案例 | PacBio 全长转录组解析,补齐大额牛种质研究关键数据短板
本研究首次对大额牛(Bos frontalis)10个不同组织进行了PacBio Iso-seq与Illumina RNA-seq联合分析,成功组装出30,760条高质量全长转录本(准确率>99%),其中86.99%的转录本可在NR数据库中获得注释,并鉴定出17,565条长链非编码RNA(lncRNA)。通过基因表达谱分析,揭示了心脏、肝脏、脾脏等10个组织的特异性表达模式及差异表达基因;同时,基于9个牛科物种的基因家族聚类和系统发育分析表明,大额牛与爪洼牛(Bos javanicus)亲缘关系最近。上述转录组资源和注释信息已通过公共数据库开放获取,为理解大额牛的分子遗传机制、进化地位以及制定保护策略提供了关键数据基础。···