1 技术简介

在植物中，通常miRNA与靶标序列结合紧密，在结合位点的第10/11位碱基处直接剪切mRNA从而调控下游的mRNA表达。被剪切后的mRNA变为两段，其中之一是含有3‘-polyA尾巴且5’不含cap的片段。在测序过程中，针对这种断片特异捕获，就是降解组测序。降解组测序的原理：miRNA剪切靶基因产生二个片段，5’剪切片段和3’ 剪切片段。其中3’剪切片段，包含有自由的5’ 单磷酸和3’ polyA尾巴，可被RNA连接酶，连接产物可用于下游高通量测序；而含有帽子结构的5’ 剪切片段或是其他缺少5’单磷酸基团的RNA是无法被RNA酶连接，因而无法进入下游的测序实验；对测序数据进行深入地比对分析，可以直观地发现在mRNA序列的某个位点会出现一个波峰，而该处正是候选的miRNA剪切位点。