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26-01

合作文章|甲基化平衡术：油菜在盐碱地的生存之道

本研究揭示耐盐甘蓝型油菜通过 DNA甲基化的双重调控机制 协同应对盐碱胁迫：一方面，胁迫诱导全基因组DNA高甲基化，特异性抑制光合作用关键基因（如RBCS） 的表达，主动减缓生长以优化资源分配；另一方面，通过靶向去甲基化 精准激活胁迫特异性的抗逆通路——盐胁迫下增强ROS清除，碱胁迫下强化氧化还原缓冲，混合胁迫下维持蛋白质稳态。该机制呈现胁迫类型特异性与亚基因组不对称性（C亚基因组响应更显著），并首次阐明DNA甲基化通过平衡光合抑制与抗逆激活，帮助植物在逆境中实现生存与防御的权衡。研究为作物表观遗传育种提供了关键靶点与新策略。···
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26-01

合作文章|ChIP-seq与RNA-seq联合解析：甲硫氨酸限制通过H3K4me3-IRF1轴调控巨噬细胞极化缓解肾IRI

该研究结合RNA-seq与ChIP-seq等组学技术，发现甲硫氨酸限制（MR）通过降低S-腺苷甲硫氨酸（SAM）水平，减少Irf1基因启动子区域的H3K4me3激活型组蛋白修饰，从而在表观遗传层面抑制干扰素调节因子1（IRF1）的表达。这一机制显著削弱了巨噬细胞向促炎M1表型的极化，进而减轻肾缺血-再灌注损伤。综合功能验证与多组学分析，得出结论：MR通过IRF1–H3K4me3轴调控巨噬细胞极化，在肾IRI中发挥净保护作用，为代谢干预治疗急性肾损伤提供了新思路。···
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26-01

合作文章|石菖蒲如何 “精准打击” 胶质瘤？网络药理学 + RNA-seq 揭秘核心机制

本研究成功开发了环境可持续且高效的深共熔溶剂超声辅助提取（DESs-UAE）技术，确定甜菜碱 - 乳酸摩尔比 1:3、水含量 21% 的 DES-14 为最优溶剂，在液固比 21 mL/g、40℃提取 30 min 的最优条件下，石菖蒲中 α- 细辛醚和 β- 细辛醚提取率分别达 4.87 mg/g 和 20.19 mg/g；NAK-9 大孔树脂与 DES-14 具优异的回收复用性，DES-14 通过增强细胞壁破碎提升提取效果，其提取物对胶质瘤生长抑制作用显著，且通过靶向 PI3K/AKT/mTOR 信号通路发挥抗胶质瘤活性，既验证了该提取技术在草药成分提取中的高效可持续性，也为胶质瘤治疗提供了新方向。···
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25-12

合作文章|ChIP-seq联合RNA-seq揭示FOXS1-BSCL2轴调控胆固醇代谢与炎症的新机制

该研究综合运用转录组学（bulk RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）等多组学技术，系统揭示了氧化低密度脂蛋白（oxLDL）通过上调转录因子FOXS1驱动钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）的新机制：FOXS1直接结合并抑制BSCL2基因启动子，导致PPARγ–LXRα信号通路下调，进而减少胆固醇转运蛋白ABCA1/ABCG1的表达，引发VICs内胆固醇蓄积；过量胆固醇激活NLRP3炎症小体，促进瓣膜间质细胞向成骨样细胞转化，最终加剧主动脉瓣钙化。该研究不仅阐明了“脂质沉积–炎症–钙化”的级联调控网络，还提出FOXS1/BSCL2轴可作为CAVD潜在的治疗靶点。···