全长转录组

全长转录组


技术简介

基于PacBio/ONT三代测序平台的全长转录组测序(Iso-Seq),可直接获得mRNA的全长序列,可更为精准地解读mRNA的结构信息。通过全长转录组测序,可克服无参考基因组物种转录本拼接短、信息不完整的难题,获取全长mRNA序列,实现同源异构体分析,单碱基变异检测, 可变剪接分析,同源基因识别及等位基因识别。

技术路线

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3 样品准备    

样本类型最低送样量建议送样量
RNA总量≥2 μg,浓度≥180 ng/μl总量≥2 g,浓度≥180 ng/μl
动物组织鲜重≥0.5 g鲜重≥2-4 g,满足2-3次提取
植物组织(叶片、根)鲜重≥0.5 g鲜重≥1-2 g,满足2-3次提取
植物组织(茎、果实、花)鲜重≥1 g鲜重≥2-4 g,满足2-3次提取
细胞≥107cell
真菌湿重≥1 g鲜重≥3-5 g
新鲜血液(抗凝)≥1 ml≥2-5 ml,满足2-3次提取
血浆、血清≥1 ml尽可能多提供(RNAde)


4 信息分析流程


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5 主要结果展示 

Species_distribution.pngAnnot_venn.png

KEGG_classification.png


PolyA_sites_number.png4.png