10x 单细胞免疫组库(BCR/TCR)

10x 单细胞免疫组库(BCR/TCR)

1  技术简介

免疫组库(immunerepertoire,IR):是指某个个体在任何特定时间点其循环系统中所有功能多样性B淋巴细胞和T淋巴细胞的总和;BCR和TCR一般由可变区(V区)、多变区(D区)、连接区(J区)、恒定区(C区)构成,V(D)J区域在遗传过程中发生重排或重组,形成大量不同的组合形式,导致BCR和TCR基因序列多样性极其丰富,使得机体能应对多样的病原微生物入侵。

传统免疫组库测序利用的是多重PCR或5’ RACE方法,但都存在一定的局限性,如多重PCR扩增法范围局限在CDR3区,5’ RACE 法只能获得单链全长信息等。单细胞免疫组库打破了传统免疫组库测序的局限,不但可以将TCR/BCR双链完美匹配,实现成对的重链和轻链(B细胞)或α和β链(T细胞)的全长测序,还可以细化到单细胞水平,并同时获得表达谱信息。

 
2  技术原理
单细胞免疫组库测序(5’scRNA + TCR/BCR)是以 10x Genomics 平台的液滴微流控技术为基础在单个细胞层面同时对转录组基因表达情况和 TCR/BCR 序列多样性进行检测的测序技术,最终,可以获得两个数据文库,分别是单细胞 5 ’端基因表达文库和免疫组库(V (D) J 文库)。

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图1. 10X 单细胞免疫组库技术原理

3  样品准备

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4 生物信息学分析流程


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5  主要结果展示(只展示标准分析部分,具体项目具体分析,详细请咨询销售)

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