1 技术简介

单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）是指在单个细胞水平上，对其转录组进行高通量测序分析的一项新技术。单细胞转录组测序能够弥补传统转录组测序（mRNA-seq：批量RNA测序，比较细胞群体所有细胞基因的平均表达值）的局限性，揭示单个细胞全基因组范围内所有基因的表达情况，包括鉴定的组织细胞类型，反映不同样本间细胞的异质性和组织微环境，让我们更好了解一个Bulk组织中每一个细胞的真实状态和关联，呈现真实且全面的细胞世界。目前，单细胞转录组测序多用于肿瘤、发育、神经、免疫微环境等复杂的多细胞系统。

2 技术原理
10X Genomics单细胞转录组技术基于微流体平台，将带有barcode、UMI（Unique Molecular Index，分子标签）、引物及酶的凝胶珠（Gel Beads）与单细胞混合。其中，细胞和反应试剂在微流控芯片上的一条通道中，凝胶珠在另一条通道，共同形成GEM。在每个GEM中独立进行反转录，之后带有标签的 cDNA 将被混合然后扩增再进行文库构建，然后使用Illumina测序平台对文库进行测序检测，即可一次性获得大量单细胞的基因表达数据，通过文库序列上的细胞标签序列可以区分目标序列来自于哪一个细胞，从而实现在单细胞水平进行转录组测序的目的。

图1. 10X 单细胞转录组技术原理

DNBelab C4是基于负压的液滴微流控系统，通过引入自主专利的液滴标签技术（Disc-seq: Droplet-indexed high-throughput single-cell sequencing），将带有标签的捕获磁珠与单个细胞或者细胞核包裹在液滴中，采用Droplet index 的技术实现磁珠的超泊松分布，在液滴中完成细胞裂解和捕获mRNA或DNA分子及用于识别来自同一液滴磁珠的标签序列，对 cDNA 和 Droplet index 进行文库构建和测序，即可一次性获得大量细胞的基因表达或染色质开放区基因信息。此技术与常规液滴单细胞测序技术如 Drop-seq 平台 1%-3% 的细胞回收率相比，回收率提高至30%-60%，显著提高了细胞的利用率，降低了单次细胞投入量。

图2. DNBelab C4 单细胞转录组技术原理

3 样品准备

4 项目经验

5 生信分析流程

6 主要结果展示（只展示标准分析部分，具体项目具体分析，详细请咨询销售）