1 技术简介
单细胞ATAC-seq技术,全称为单细胞转座酶可接近染色质测序技术(Single-Cell Assay for Transposase - Accessible Chromatin using sequencing)。通过将单个细胞分离并利用DNA转座酶进行转座反应,然后对其进行测序,从而获得单个细胞的染色质开放区域的信息。这种方法可以解决细胞异质性问题,揭示不同细胞之间的染色质可及性差异和功能差异 。
图1. 染色质可及性 图2. Tn5酶切割开放染色质区域
2 技术原理
单细胞ATAC技术可在单细胞水平对细胞的染色质开放区域进行检测。首先,转座酶进入细胞核,优先在染色质的开放区域切割 DNA,同时在 DNA片段的未端添加测序引物;其次,带有条形码的凝胶珠在油滴内对每个细胞内的 DNA片段进行 barcode 标记,带有 barcode 标签的 DNA 进行后续文库构建;最后,通过测序平台对文库进行测序检测,即可一次性获得大量单细胞的 DNA 染色质开放区域数据。
图3. 单细胞ATAC技术原理
单细胞多组学 ATAC +转录组是一种以数千个细胞为研究对象,同时分析同一细胞中的基因表达和开放染色质的技术,它可以带来细胞的基因表达谱及其表观基因组景观的一体化视图。这种分析不仅可以帮助识别不同类型的细胞,还能揭示决定细胞身份和行为的遗传和表观遗传因素。这种综合分析方法的应用,极大地增强了科研工作者对细胞功能和调控机制的理解,特别是在复杂的生物体如人类中,这对于理解疾病的发生和发展具有重要意义。
图4. 单细胞ATAC+单细胞转录组技术原理
3 样品准备
4 生物信息学分析流程
5 主要结果展示(只展示标准分析部分,具体项目具体分析,详细请咨询销售)
差异peak分析