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22-12

项目文章（IF:13.211）|横断山叶片-土壤δ15N的海拔变化及其潜在机制研究

自然丰度稳定氮同位素(δ15N)为陆地生态系统氮动态变化提供了很好的研究手段，被认为是很好地理解生态系统氮循环的有效途径。然而，目前关于山地生态系统叶片-土壤δ15N变化的模式和机制的研究还相对较少。在本研究中，作者研究了横断山脉叶片-土壤δ15N与氮运输速率的决定因素。揭示了叶片-土壤δ15N随海拔梯度的变化及与氮运移速率的关系。该研究结果强调了微生物固定化在土壤氮动态中的重要性，提供了新的见解，有助于提高我们对叶面-土壤δ15N沿海拔梯度氮循环的理解。百易汇能生物在本研究中提供了绝对定量服务。···
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22-12

Cancer Cell｜沈洪兵/胡志斌团队发表迄今最大规模中国人群NSCLC全基因组测序成果，揭示肺癌罕见易感变异

肺癌是对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。目前，基因测序技术已在NSCLC诊断、靶向治疗、预后研究中发挥了关键作用。在过去的20年里，虽然全基因组关联研究（GWAS）已经将40余个遗传位点与NSCLC联系起来，但前期大多数研究都是基于欧洲人群进行的，目前仍缺乏对于中国人群的大规模研究，并且基于基因阵列插补的传统GWAS仍然存在一定的局限性。本研究将WGS技术应用于中国人群肺癌致病变异的鉴定不仅可以构建中国人群的特异性单倍型基因参考数据库，提高常见和低频变异插补的准确性和覆盖度，增加发现新易感变异的可能性，还可以为系统发现肺癌罕见致病变异提供信息。···
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22-12

干货分享| 转录组个性化分析(2)——GSEA

基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA）：用一个预先定义的基因集中的基因来评估在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势，从而判断其对表型的贡献。GSEA和常规的GO、KEGG的差异在于，GSEA使用的是基因集，可以回答如下问题：一个富集到的通路下，既有上调差异基因，也有下调差异基因，那么这条通路总体的表现形式究竟是怎样呢，是被抑制还是激活？或者更直观点说，这条通路下的基因表达水平在实验处理后是上升了呢，还是下降了呢？想要知道进行了差异分析的两组有什么功能和通路的差别，手上有大部分的功能分子以及对应的值，这个值可以是 logFC。可以用这个 logFC作为分子的排序，从而来评估在预先定义的基因集中是否显著富集。···
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22-12

我国科学家通过全基因组测序+GWAS联合分析揭示海岛棉育种谱系及其选择效果

海岛棉是世界上最优良的棉纤维，其热胀冷缩的性能突出，有“羊绒质感，丝绸光泽”的美誉。目前，我国的自育海岛棉品种产量高、品质优良、抗病性好，满足了新疆南疆地区大面积种植生产需求。但对不同种质之间的遗传变异、重要性状的基因和家系选择的影响知之甚少。本研究通过对336份自育和引进品种组成的海岛棉群体进行基因组分析和全基因组关联分析，揭示中国海岛棉的谱系基因组关系，并筛选到5个参与调控纤维强度、长度、枯萎病抗性的基因，为了解海岛棉花的基因组变异和选择性育种提供了基础。···