公司动态

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22-12

Nature｜首个高质量二倍体人类参考基因组！PacBio、Nanopore、Bionano、Hi-C技术各显神通

2001年，人类参考基因组草图正式发布。目前，人类参考基因组已更新到GRCh38版本，补充完善了全基因组序列数据。GRCh38是现有的最完整的人类参考基因组之一，但其仍存在许多空白和错误，未能充分捕捉人类全部基因组的变异信息。近日，HPRC在Nature上发表了题为“Semi-automated assembly of high-quality diploid human reference genomes”的文章，报道了其评估结果。研究人员确定了目前可以实现最完整和最准确的二倍体基因组组装的基因组测序和组装方法组合，且人工整理的工作量最小；组装了第一个高质量的二倍体参考基因组；发现了更多单倍型之间的遗传变异，约48%的蛋白质编码基因在单倍型间存在非同义氨基酸变化，其中中心粒区多样性最高。为实现自动化、完整、无错的二倍体基因组组装，研究人员还确定了需要改进的部分。总之，该研究为大规模组装接近完整的二倍体人类基因组提供了基础，能捕获从单核苷酸到结构重排的全局遗传变异。···
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22-12

肉鸭育种新突破！中国农大家禽育种团队在鸭功能基因组研究中取得重要进展

鸭是人类食用的肉和蛋的主要来源，也是羽毛的重要来源。在本研究中，作者为绿头鸭和两种不同品种的家鸭测定了三个高质量的基因组，鉴定了3600多万个与驯化过程相关的SNP、InDEL和结构变异；同时，发现了鸟类被认为的“缺失基因”在基因组中存在，进一步否定了鸟类“缺失基因假说”；此外，作者还获得了几种鸟类中CTL蛋白成员的完整cDNA序列，这些新发现的CTL家族成员扩大了对蛋壳生物矿化的认识；还利用敲除模型证实了NR2F2基因在鸭体内的抑制脂肪生成的功能。该研究结果为鸭遗传育种、鸟类进化及蛋壳特征变化研究提供了新见解。···
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BINH研究基金 I 不同膳食结构餐后代谢差异大！究竟什么方式才是减肥最佳答案？

我们在减肥的过程中使用的这些五花八门的方法，究其根本却万变不离其宗。选择不同的饮食结构，实际上变化的主要是宏量营养素（碳水化合物、脂肪和蛋白质等）摄入的总量和比例；选择不同的运动实际也对应着不同的能量消耗。最近，国际营养领域著名期刊Journal of Nutrition发表了中国科学院上海营养与健康研究所林旭教授课题组的文章。首次系统地研究了在等能量条件下，不同膳食宏量营养素比例、体质指数（BMI）以及运动、静息状态对于能量代谢和临床心血管代谢相关指标以及代谢组谱的影响···
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22-12

干货分享| 转录组个性化分析(3)——富集弦图

文献中通常会看到色彩绚丽的富集弦图，那么富集弦图具体有怎样的功能呢？如何绘制富集弦图呢？快来跟随小编一起来学习学习，有兴趣的小伙伴们可以拿自己手上的GO、KEGG富集的结果，动手尝试绘制一下吧！通常我们做完差异表达基因筛选后，会使用柱形图或点图来展示通路富集分析结果，但柱形图或点图只能突出展示富集率而不能展示基因和通路的关系以及指示通路功能强弱的变化。而弦状图这种类型的图表通路富集弦图既显示了参与通路的基因有哪些，还按照变化倍数对上调/下调基因进行了排序；同时能够显示到底是哪些基因参与了何种通路，并将富集分析的通路按照强弱进行了排序。···