联合分析专题(6)!!带你了解单细胞转录组+空间转录组联合分析在医学方向的研究思路
单细胞转录组测序是在单细胞水平对转录组进行测序的一项新技术,可以研究单个细胞内的基因表达情况,同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为了现实。空间转录组技术是结合成像、生物标记、测序及生物信息学等工具对组织切片的基因表达进行空间定位的一项技术,可揭示各细胞类型在组织中的空间分布、各细胞群体间的相互作用以及绘制不同组织区域的基因表达图谱,对于理解疾病和癌症的发生机制具有深远的应用价值。目前scRNA-seq将每个转录物与单个细胞相关联,但关于这些转录物在组织中的位置信息丢失了;相反的,空间转录组学技术能获取转录物表达空间信息,却丢失了单个细胞异质性。因此,综合两种技术可实现将不同单细胞的亚群进行空间定位,对空间转录组的位置区域进行细胞类型注释。···