Nat Rev Clin Oncol综述 | 深入解析癌症的空间组学景观——机遇与挑战并存
空间生物学的概念由来已久，几十年来，科研人员利用显微镜获取肿瘤的空间信息，依靠基于靶向蛋白质的技术对肿瘤进行表征，如免疫组织化学（IHC）和免疫荧光等，揭示了具有预测和/或预后价值的组织学模式。但这些技术需预先选择靶分子、分辨率有限并存在因样本选择导致的偏差问题。此外，基因组学的进步在提高癌症诊断和预测的准确性以及指导新治疗方法方面显示出越来越大的效用，但许多基因组学方法未能完全捕获样本的潜在细胞异质性。在过去十年中，单细胞基因组学方法（单细胞RNA测序，scRNA-seq）的进步为肿瘤复杂的细胞和分子景观提供了广泛的见解，但其缺乏空间背景，无法获取组织结构和细胞相互作用的基本信息。目前，人们已开发了一系列空间分析技术来表征基因组、转录组和蛋白质组；特别地，空间转录组学技术的出现在一定程度上弥补了上述缺陷，其提供了空间分辨转录组学（SRT）数据，在探索肿瘤空间结构和肿瘤微环境（TME）中发挥着重要作用。已有研究表明，空间转录组学技术可在亚细胞空间分辨率上解析基因表达，揭示具有临床意义的生物学新发现。···
