成功案例|Stereo-seq+scRNA-seq 联手破局!斑马鱼心脏再生全景图谱发布,公开数据库助力心血管再生研究
本研究整合空间转录组学(Stereo-seq 技术)与单细胞 RNA 测序(scRNA-seq),构建了覆盖八个阶段的斑马鱼再生心脏时空分辨率分子与细胞图谱;明确了负责生成再生心肌的心肌细胞状态级联反应,并探究了 tpm4a 基因在心肌细胞再分化过程中可能发挥的作用。此外,研究发现 ifrd1 和 atp6ap2 基因的激活是再生心脏特有的特征。最后,作者基于scRNA-seq文库和Stereo-seq切片,重构出包含569,896个细胞/位点的4D “虚拟再生心脏”。该研究构建的全面图谱为心血管和再生领域的科研人员提供了宝贵资源,助力持续深入研究脊椎动物心脏再生背后的分子和细胞机制。···