衣被天下、无棉不安—3个现代品种棉花高质量基因组组装和结构变异挖掘
棉花是全球重要的可再生纤维作物,但由于基因型特异性以及品种、管理时间和环境因素之间的复杂相互作用,其产量和纤维品质表现出了高度可变性。由于初始基因库的狭窄,现代育种可能会限制未来棉花产量的增长。依赖准确的品种特异性数据,精确育种和生物技的应用为上述问题提供了潜在的解决方案。因此,作者通过生成三个现代棉花品种(“UGA230”、“UA48”和“CSX8308”)的高质量参考基因组并更新“TM-1”棉花基因组来满足这一需求。分析结果显示在四个基因组中观察到相当大的序列和结构变异,这些变异与“Pima”棉花的基因组渗入、基因调控机制以及表型性状分化有关。这些基因组和比较分析为未来提高全球棉花产量和可持续性的基因研究提供了宝贵的基础。···