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23-04

干货！！带你了解宏基因组+代谢组联合分析在医学方向的研究思路

宏基因组研究可以获得微生物群落组成及丰度信息，但是这些信息并不足以充分说明微生物是通过何种方式影响宿主或环境。代谢组学是基于LC-MS/MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物进行定性和相对定量分析。宏基因组-代谢组的联合分析可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性，从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系。···
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23-04

合作文章|转录组测序助力发现抑制细胞外调节蛋白激酶促进同种异体移植物植入

免疫抑制是治疗自身免疫性疾病、免疫介导的炎症和同种异体移植排斥反应的主要治疗策略之一。T细胞的激活通过多种机制发挥着核心的致病作用，包括促炎性细胞因子的产生、死亡受体配体的表达和细胞毒性等。细胞外调节蛋白激酶（ERK）信号通路是细胞行为、生命的主要调节因子，研究显示ERK通路参与了T细胞的活化，但对其在同种异体移植排斥反应发展中的作用知之甚少。在本研究中，作者利用小鼠同种异体心脏移植模型来研究受体T细胞中ERK信号的激活状态，利用表面等离子体共振（SPR）技术，鉴定了一种ERK的特殊抑制剂。作者还探讨了ERK抑制对T细胞激活的影响。此外，考虑到ERK和T细胞代谢之间的关系，作者还通过转录组测序分析评估了ERK抑制后T细胞中细胞能量代谢的变化。百易汇能生物在本次研究中担任了转录组测序分析工作。···
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23-04

合作文章|微生物多样性分析助力长期连续种植对永丰山药根际土壤细菌群落及功能的影响

山药块茎富含抗性淀粉、多糖、甾体皂苷、矿物质等营养成分，不仅可作为食物，还可被用于治疗糖尿病、腹泻、哮喘等疾病。此外，山药的块茎还具有降低血糖、调节血压、增强免疫力、抗衰老、抗肿瘤突变等益处。由于可耕地数量有限，人们对山药进行大规模的单一栽培，而连续单一栽培的山药较容易出现植物再植病，造成了严重的土壤病害，导致产量下降，造成重大的经济损失，严重制约了山药产业的发展。本研究采用高通量测序技术研究了不同连续栽培年后永丰山药根际土壤细菌群落的变化，分析了不同连续栽培年后土壤理化性质与微生物群落多样性和组成的相关关系。旨在为缓解连作障碍提供理论基础，了解连作障碍的机制，对指导农业实践具有重要意义。百易汇能生物在本次研究中担任了测序分析工作。···
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23-04

合作文章|转录组测序助力甜橙中WRKY转录因子响应病原体感染的调控机制研究

2023年2月3日，西南林业大学刘小珍副教授团队在Current Issues In Molecular Biology上发表了“Genome-Wide Identification of Sweet Orange WRKY Transcription Factors and Analysis of Their Expression in Response to Infection by Penicillium digitatum”一文。在本研究中，作者对甜橙转录因子（CsWRKY）进行了全基因组鉴定、分类、系统发育和保守结构域分析，分析了编码基因的结构和染色体定位，并利用转录组数据探讨CsWRKY基因在柑橘绿霉菌胁迫下的表达模式，并对相关基因进行功能预测。百易汇能生物在本次研究中担任了转录组测序分析工作。···