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23-05

​Plos Biology | 40种人类常见脑部疾病转录组学分析，提供基于分子的疾病分类和比较新策略

美国华盛顿大学艾伦脑科学研究所、加拿大麦吉尔大学等单位的研究人员在Plos Biology发表了题为“A comparison of anatomic and cellular transcriptome structures across 40 human brain diseases”的研究文章。研究团队分析了艾伦人脑图谱（Allen Human Brain Atlas）中的基因表达数据，通过对40种常见人类脑部疾病的分析，研究团队确定了5种主要的转录模式，分别代表肿瘤相关、神经退行性、精神和药物滥用，以及影响基底神经节和下丘脑的2组混合疾病。此外，通过小鼠和人类之间同源细胞类型的定位，发现大多数疾病风险基因在常见细胞类型中起作用，同时具有物种特异性表达，并在物种内保持相似的表型分类。总之，该研究描述了成人大脑中疾病风险基因的结构和细胞转录组关系，为疾病分类和比较提供了一种分子策略，有望为开发大脑病理生理学的研究方法提供重要见解。···
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23-05

联合分析专题！！带你了解转录组+蛋白质组联合分析在医学方向的研究思路

蛋白质是生命功能的直接执行者，蛋白组是一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学是对蛋白质组的研究，研究不同的蛋白质之间如何相互作用以及它们在生物体内发挥的作用。转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整转录信息的集合，代表了基因表达的中间状态，是基因功能及结构研究的基础和出发点，能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息。蛋白质组学与转录组学联合分析， 就是通过对转录组数据和蛋白质组数据进行联合分析，挖掘mRNA与蛋白的表达水平，充分利用转录组和蛋白质组研究的差异性和互补性，对基因的表达水平进行全方位的衡量，以获得基因表达各个步骤表达和调控的全景图，发掘常规单个组学未能发现的新结果，全面探究生物体疾病机理，生长发育机制等。···
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23-05

合作文章（IF=4.927）|转录组测序助力肝炎发病机制的研究

伴刀豆素球蛋白A（Concanavalin A，Con A）是从谷类植物种子中分离出来的一种植物血凝素，静脉注射Con A是一种广泛使用的小鼠急性免疫介导的肝炎模型。在本研究中，作者构建了免疫缺陷小鼠模型，检测了Con A在常规致死剂量下的体内肝毒性，监测了Con A诱导的肝细胞死亡的进展，并在体外探索了其机制途径。此外，作者对体内实验的肝组织和体外实验的肝细胞进行了RNA测序，分析了Con A治疗前后转录组的变化，并确定了关键的转录因子，为Con A型肝炎的发病机制提供了新的基础。百易汇能生物在本次研究中担任了转录组测序分析工作。···
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23-05

联合分析专题！！带你了解转录组+代谢组联合分析在医学方向的研究思路

转录组是研究功能基因的利器，通过转录组测序可以得到大量差异基因和众多调控网络，围绕转录组开展的多组学分析策略已是多种类型高分文章的必备“法宝”。但是单一的转录组难以确定关键途径，也无法鉴定控制关键途径的结构。代谢组学是基于LC-MS/MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物进行定性和相对定量分析。可以利用代谢组来反映表型的状态变化，但是单独代谢组检测，无法解释影响表型的基因机理。转录组+代谢组的多组学分析，可以同时实现从“因”和“果”两个层面来探究生物学问题，相互间进行验证，从海量的数据中筛选出关键基因、代谢物及代谢通路，深度解析生物系统的宏观发育过程，解释生物过程的复杂性和整体性。···